Jason Bourne w wyniku wypadku traci pamięć. Wszystko wskazuje na to, że był członkiem tajnego programu CIA.
Ktoś podszywa się pod Bournea i morduje agentów CIA w Berlinie. Po nieudanym zamachu na swoje życie były agent ponownie stawia czoła mrocznej przeszłości.
Jason Bourne wpada na trop tajnego programu CIA Blackbriar, który ma związek z mroczną przeszłością agenta.
Aaron Cross został poddany modyfikacjom genetycznym w ramach tajnego programu Outcome. Kiedy jemu podobni agenci są eliminowani, mężczyzna używa wszystkich zdolności, by przeżyć.
Znając własną tożsamość, Jason Bourne próbuje rozwikłać zagadkę śmierci swojego ojca.
